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リリース情報

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第16回公開情報

 

第16回公開情報 (2010.3.12)


  生物種 更新有無 Readme ER図 Table ダウンロード
System GNP Viewer
System
Human,Mouse 無し - - - Viewer
Integrated Database CAGE
Database
Human 無し Readme ER Table Download
Mouse 無し Readme ER Table Download
qRT-PCR
Database
Human 無し Readme ER Table Download
Mouse 無し Readme ER Table Download
PPI Experimental
Database
Human,Mouse 無し Readme ER Table Download
PPI Public
Database
Human,Mouse,Rat 無し Readme ER Table Download
All PPI Database Human,Mouse,Rat 無し Readme ER Table Download
clone Database Human 有り Readme ER Table Download
Viewer
Database
Human,Mouse 有り Readme ER Table Download
GNP Integrate
Database
Human,Mouse 無し Readme ER Table Download
GNP
Experimental
Data
CAGE Human 無し - no no DL Page
qRT-PCR Human 無し - no no DL Page
Mouse 無し - no no DL Page
Tiling Array Human 無し - no no DL Page
Mouse 無し - no no DL Page
Micro Array Human 無し - no no DL Page
Mouse 無し - no no DL Page
short RNA Human 無し - no no DL Page
Y2H Human 無し - no no DL Page
M2H Human 無し - no no DL Page
Mouse 無し - no no DL Page
IVV Human 無し - no no DL Page
PPI Others Human 無し - no no DL Page
Clone Human 有り - no no DL Page

データ登録件数

DB分類 データ種別 レコード単位 レコード数 データ取り込み日 データ産生元
GNP Data CAGE(human) Tags 42,975,553 2008.05.01 理化学研究所
RNA samples 117
PPI Y2H interactions 1,478 2008.06.01 日立製作所
proteins 1,067
M2H interactions 1,381 2009.3.27 理化学研究所
proteins 794
IVV interactions 933 2010.02.23 慶応大学
proteins 721
Other interactions 21 2008.08.26 東北大学
proteins 23
qRT-PCR(human) genes 2,353 2009.10.29 理化学研究所
RNA samples 88
qRT-PCR(mouse) genes 1,559 2007.09.28 理化学研究所
RNA samples 24
Tiling Array (Titech, human) dataset 4 2009.10.29 東京工業大学
(RIKEN, human) dataset 11 2008.11.05 理化学研究所
(RIKEN, mouse) dataset 3 2008.04.25 理化学研究所
(Kyoto Univ, mouse) dataset 3 2009.10.29 眞貝研
cDNA Clone clones 28,753 2010.03.08 理化学研究所
Gateway Clone clones 34,454 2010.03.08 理化学研究所
short RNA sequences 874,305 2008.02.28 理化学研究所
RNA samples 17
small RNA sequences 154,666 2008.08.11 塩見研
RNA samples 3
Affymetrix microarray human probes 22,277 2007.09.28 理化学研究所
RNA samples 2
mouse probes 45,101 2007.06.25 影山研
RNA samples 10×3
probes 45,101 2007.07.20 影山研
RNA samples 6
probes 45,101 2007.06.25 影山研
RNA samples 2×2
probes 45,101 2008.08.21 白澤研
RNA samples 2×3
probes 45,101 2008.10.22 白澤研
RNA samples 2×2
probes 45,101 2009.3.31 古関研
RNA samples 52
probes 45,101 2009.8.31 米原研
RNA samples 6
Illumina microarray probes 47,293 2008.05.01 理化学研究所
RNA samples 102
Agilent microarray / miRNA(human) miRNA 534 2008.05.01 理化学研究所
RNA samples 10
Public DB Gene EntrezGene human genes 45,368 2009.09.13 -
EntrezGene mouse genes 61,456 2009.09.13 -
PPI interactions 56,497 2009.09.13 -
proteins 10,505 2009.09.13 -
Expression(H-ANGEL) RNAs 48,147 2008.08.01 -
tissues 40 2008.08.01 -
CAGE (mouse) Tags 11,567,973 2008.02.01 -
RNA samples 209 2008.02.01 -
UniProt proteins 136,292 2009.09.13 -
InterPro domains 18,843 2009.09.13 -
GO GO terms 29,654 2009.09.13 -
OMIM MIM IDs 20,605 2009.09.13 -
miRBase miRNA 10,097 2009.09.13 -