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M2H Data

 

データダウンロード

PPI の M2H Data をダウンロードできます。
このゲノムネットワークプラットフォームのデータを利用されて「論文発表」「研究発表」をなされた場合は、利用データの出典を明記するようにお願いします。
[Human]
公開日付 データ名称 生物種 データ種別 ファイル名 形式 README ダウンロード
2010.3.5 縦軸研究機関からの依頼によるM2Hデータ(理研) Human Interaction
(PPI)
PPI.20090324.xls
(597KB)
Excel - ダウンロード
2010.3.5 M2Hクローンのリスト(理研) Human Interaction
(PPI)
HumanPPI_all_list.xls
(5MB)
Excel - ダ>ウンロード
2010.3.5 不使用M2Hクローンのリスト(H20 シリーズ)(理研) Human Interaction
(PPI)
HumanPPI_H20_Discarded
_checked.xls (219KB)
Excel - ダ>ウンロード
2010.3.5 不使用M2Hクローンのリスト(H213 シリーズ)(理研) Human Interaction
(PPI)
H213series_Discarded.xls
(30KB)
Excel - ダ>ウンロード
2010.3.5 PPIクローン二項関係の、従来通りのフォーマット(理研) Human Interaction
(PPI)
Human-TF-PPI.xls
(431KB)
Excel Readme ダウンロード
2010.3.5 理研でGeneID二項関係にまとめ直したデータ(理研) Human Interaction
(PPI)
Human-TF-PPI_Reliable
_070626.xls
(1MB)
Excel Readme ダウンロード
2010.3.5 PPIクローン情報
(理研)
Human Interaction
(PPI)
Human-TF-PPI-sampleid.xls
(315KB)
Excel Readme ダウンロード
[Mouse]
公開日付 データ名称 生物種 データ種別 ファイル名 形式 README ダウンロード
2010.3.5 PPIクローン二項関係の従来道理のフォーマット(理研) Mouse Interaction
(PPI)
Mouse-TF-PPI.xls
(571KB)
Excel Readme ダウンロード
2010.3.5 理研でGeneID二項関係にまとめ直したデータ(理研) Mouse Interaction
(PPI)
Mouse-TF-PPI_
Reliable_070626.xls
(324KB)
Excel Readme ダウンロード
2010.3.5 PPIクローン情報
(理研)
Mouse Interaction
(PPI)
Mouse-TF-PPI-sampleid.xls
(324KB)
Excel Readme ダウンロード
Reference

An atlas of combinatorial transcriptional regulation in mouse and man.

Ravasi T, Suzuki H, Cannistraci CV, Katayama S, Bajic VB, Tan K, Akalin A, Schmeier S, Kanamori-Katayama M, Bertin N, Carninci P, Daub CO, Forrest AR, Gough J, Grimmond S, Han JH, Hashimoto T, Hide W, Hofmann O, Kawaji H, Kubosaki A, Lassmann T, van Nimweg en E, Ogawa C, Teasdale RD, Tegnr J, Lenhard B, Teichmann SA, Arakawa T, Ninomiya N, Murakami K, Tagami M, Fukuda S, Imamura K, Kai C, Ishihara R, Kitaz ume Y, Kawai J, Hume DA, Ideker T, Hayashizaki Y.

http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2010.01.044

The transcriptional network that controls growth arrest and differentiation in a human myeloid leukemia cell line

Suzuki H, Forrest ARR, Van Nimwegen E, Daub CO, Balwierz P, Irvine K, Lassman T, Ravasi T, Hasegawa Y, de Hoon M, Katayama S, Schroder K, Carninci P, Akalin A, Ando Y, Arner E, Asada M, Asahra H, Bailey T, Bajic V B, Bauer D, Beckhouse A, Bertin N, Bjorkegren J, Brombacher F, Bulger E, Chalk A M, Chiba J, Cloonan N, Dawe A, Dostie J, Engstrom P G, Essack M, Faulkner G J, Fink J, Fredman D, Fujimori K, Furuno M, Gojobori T, Gough J, Grimmond S, Gustafsson M, Hashimoto M, Hashimoto T, Hatakeyama M, Heinzel S, Hide W, Hofmann O, Hornquist M, Huminiecki L, Ikeo K, Imamoto N, Inoue S, Inoue Y, Ishihara R, Iwayanagi T, Jacobsen A, Kaur M, Kawaji H, Kerr MC, Kimura R, Kimura S, Kimura Y, Kitano H, Koga H, Kojima T, Kondo S, Konno T, Krogh A, Kruger A, Kumar A, Lenhard B, Lennartsson A, Lindow M, Lizio M, MacPherson C, Maeda N, Maher CA, Maqungo M, Mar J, Matigian NA, Matsuda H, Mattick JS, Meier S, Miyamoto S, Miyamoto-Sato E, Nakabayashi K, Nakachi Y, Nakano M, Nygaard S, Okayama T, Okazaki Y, Okuda-Yabukami H, Orlando V, Otomo J, Pachkov M, Petrovsky N, Plessy C, Quackenbush J, Radovanovic A, Rehli M, Saito R, Sandelin S, Schmeier S, SchoNnbach C, Schwartz AS, Semple CA, Sera M, Severin J, Shirahige K, Simons C, St. Laurent G, Suzuki M, Suzuki T, Sweet MJ, Taft RJ, Takeda S, Takenaka Y, Tan K, Taylor MS, Teasdale RD, TegneLr J, Teichmann S, Valen E, Wahlestedt C, Waki K, Waterhouse A, Wells CA, Winther O, Wu L, Yamaguchi K, Yanagawa H, Yasuda J, Zavolan M, Hume DA, Arakawa T, Fukuda S, Imamura K, Kai C, Kaiho A, Kawashima T, Kawazu C, Kitazume Y, Kojima M, Miura H, Murakami K, Murata M, Ninomiya N, Nishiyori H, Noma S, Ogawa C, Sano T, Simon C, Tagami M, Takahashi Y, Kawai J, Hayashizaki Y.

http://dx.doi.org/10.1038/ng.375

Tiny RNAs associated with transcription start sites in animals

Taft RJ, Glazov EA, Cloonan N, Simons C, Stephen S, Faulkner GJ, Lassmann T, Forrest ARR, Grimmond SM, Schroder K, Irvine K, Arakawa T, Nakamura M, Kubosaki A, Hayashida K, Kawazu C, Murata M, Nishiyori H, Fukuda S, Kawai J, Daub CO, Hume DA, Suzuki H, Orlando V,Carninci P, Hayashizaki Y, Mattick JS.

http://dx.doi.org/10.1038/ng.312

The regulated retrotransposon transcriptome of mammalian cells

Faulkner GJ, Kimura Y, Daub CO, Wani S, Plessy C, Irvine KM, Schroder K, Cloonan N, Steptoe AL, Lassmann T, Waki K, Hornig N, Arakawa T, Takahashi H, Kawai J, Forrest ARR, Suzuki H, Hayashizaki Y, Hume DA, Orlando V, Grimmond SM, Carninci P.
Nature Genetics, 41:5, 563-571 (2009)

http://dx.doi.org/10.1038/ng.368

The FANTOM Web Resource: from mammalian transcriptional landscape to its dynamic regulation

Kawaji H, Severin JM, Lizio M, Waterhouse AM, Katayama S, Irvine KM, Hume DA, Forrest ARR, Suzuki H, Carninci P, Hayashizaki Y, Daub CO.,

http://dx.doi.org/10.1186/gb-2009-10-4-r40